期刊简介

               本刊为综合性医学学术期刊,反映该校学科科研进展与动态,刊登基础医学方面的研究成果及临床诊疗经验。主要栏目有:基础研究、临床研究、技术方法、经验交流、病例报告、科研管理、短篇报道等。读者对象为医学研究人员、医务工作者及医学院校师生。本刊被美国《医学索引》(IM)、《化学文摘》等收录,2005年中国科技信息所公布的影响因子为0.869。                

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  • 杂志名称:南方医科大学学报杂志
  • 主管单位:广东省教育厅
  • 主办单位:南方医科大学
  • 国际刊号:1673-4254
  • 国内刊号:44-1627/R
  • 出版周期:月刊
期刊荣誉:中国综合性医药卫生类核心期刊期刊收录:万方收录(中), 国家图书馆馆藏, JST 日本科学技术振兴机构数据库(日), 上海图书馆馆藏, 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 知网收录(中), 文摘与引文数据库, 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 维普收录(中), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), CA 化学文摘(美)
南方医科大学学报杂志2016年第01期

限制性标记基因组扫描分析在前列腺腺癌基因组CpG岛的异常甲基化

李东;徐战平;刘久敏;蒲小勇;罗耀雄;郑祥光

关键词:限制性标记基因组扫描, 前列腺癌, 良性前列腺增生, DNA甲基化, DPYS
摘要:目的 用限制性标记基因组扫描(RLGS)分析前列腺腺癌基因组CpG岛的异常甲基化,为前列腺腺癌相关基因的甲基化研究奠定基础.方法 采用激光捕获显微切割技术从20例前列腺腺癌和18例良性前列腺增生组织中捕获均一同质的腺体细胞,提取DNA,利用RLGS技术对这些样本基因组CpG岛扫描,比较前列腺腺癌和良性前列腺增生的CpG岛甲基化差异,筛选出参与前列腺腺癌发生的CpG岛甲基化基因.将其上传至DAVID数据库进行GO分析,并对筛选出甲基化显著的基因DPYS进行焦磷酸测序.结果 前列腺腺癌和良性前列腺增生分别有10245个和8658个CpG岛发生甲基化,甲基化发生率分别为37.2%和30.3%,其中超过60%为启动子区CpG岛.前列腺腺癌与良性前列腺增生存在差异甲基化的CpG岛有735个,其中高甲基化458个,去甲基化256个.筛选出DPYS、P16、APC、GSTP1、TMEM 122、RARB、ARHGAP20等7个前列腺腺癌甲基化显著的基因.生物信息学分析提示这些基因涉及多个分子功能和生物过程,其中DPYS参与了13个GO注释的生物功能,50种疾病的发生发展和47个蛋白间的相互作用.对CpG岛7个位点进行焦磷酸测序,平均甲基化频率为32.7%.可能在前列腺腺癌发生发展中存在重要的意义.结论 RLGS发现前列腺腺癌和良性前列腺增生之间存在大量CpG岛高甲基化和去甲基化改变.筛选出甲基化显著的基因DPYS在前列腺腺癌发生和发展中起重要作用,机制有待进一步研究.